看你住在什么位置，建议住在北四环——北五环内，因为你去的地方大部分在北京城区西北侧。建议选择有地铁4号线的位置。
D1：地铁1号线到天安门东或者西，上午游览天安门、故宫，下午地铁5号线到天坛。（一天时间挺紧的，实在没时间就放弃天坛，没啥意思）
D2：地铁4号线到颐和园，下午4号线去清华北大，晚上鸟巢、水立方。（这一天也挺累，清华北大选其一即可）
D3：2号线东直门好像有车到长城（不过要看你去哪个长城了，水关、居庸关近），或者2号线到西直门的北京北站，做S6线到较远的八达岭长城。
3天时间去这么多地方，挺累的

D1：参观鸟巢、水立方（如果时间紧这个也可以放在晚上，两座建筑物的夜景很美），白天可以安排清华和北大。
D2：长城，十三陵。建议通过携程报个一日游的团，既节约了时间，又免得路途奔波太累。
D3:如果想看升旗可以安排一次，如果觉得早起太辛苦，也可以看降旗，反正都很有仪式感的。看完升旗顺便参观天安门广场、毛主席纪念堂、人民大会堂，然后去故宫，天坛。

你要求的比较多，时间太紧
D1: 天安门，故宫，景山，大栅栏
D2: 长城，鸟巢，水立方。 鸟巢旁边是中国科技馆（17点关门），如果从长城回来早可以去那里
D3: 颐和园，圆明园，清华，北大
天坛可以早起7点以前进入，这样结束后可以去天安门。当然如果想悠闲一点好好玩就放弃颐和园去天坛，剩下的时间可以选择国家博物馆或者雍和宫+国子监
酒店找地铁站旁边

您好！欢迎来北京旅游！三天不多，还带小孩，建议就玩精华景点。
第一天：天安门 故宫（周一闭馆） 天坛，下午和晚上有时间可以去大栅栏品老北京美食，逛老字号
第二天：颐和园 科技馆（寓教于乐，呵呵） 清华北大（我觉得去其中一个就可以了） 鸟巢和水立方夜景
第三天：八达岭长城　十三陵